Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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FOXE3Q13461 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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FOXE3Q13461 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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FOXE3Q13461 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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