Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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