Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD2Q13200 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD2Q13200 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms