Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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MKRN3Q13064 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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