Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms