Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms