Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms