Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms