Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms