Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1Q07954 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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