Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms