Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms