Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms