Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms