Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALDH6A1Q02252 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms