Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms