Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MC1RQ01726 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms