Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms