Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms