Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD3P84022 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms