Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG7P83436 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG7P83436 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COG7P83436 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG7P83436 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG7P83436 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG7P83436 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms