Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMF1P82094 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMF1P82094 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms