Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms