Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms