Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms