Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL3P58872 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL3P58872 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL3P58872 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL3P58872 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL3P58872 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL3P58872 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL3P58872 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL3P58872 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms