Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX17P56962 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STX17P56962 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STX17P56962 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STX17P56962 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STX17P56962 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STX17P56962 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STX17P56962 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX17P56962 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms