Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLTPP55058 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms