Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms