Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms