Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ME1P48163 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ME1P48163 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ME1P48163 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME1P48163 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME1P48163 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms