Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms