Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNT2P45379 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms