Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms