Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPOP42166 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPOP42166 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms