Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms