Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms