Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms