Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTX2P32243 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms