Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms