Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHC1P29353 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms