Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAP3P28838 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAP3P28838 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAP3P28838 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms