Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms