Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms