Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO1P25800 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO1P25800 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms