Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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