Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms