Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD53P19397 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD53P19397 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms