Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms