Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME1P15531 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME1P15531 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms